同一のカラー値が割り当てられているパレットエントリや、インデックスカラーイメージにおいて未使用のパレットエントリを検出し、それに対して統合や削除などの処理を行うには、メインメニューから[パレット]-[パレット整理]を選びます。
対象
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パレットエントリ0は処理しない- 
パレットエントリ0は、整理対象から除外します。
 
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整理方法
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本処理として行う作業内容を選択します。何もしない(後処理のみを実行) 統合や置き換えなどの処理を行いません。 同一色のパレットエントリを統合する アルファ値も比較する指定パレットエントリの色と同じにする [パレットエントリ]で指定したパレットエントリのカラー値を、他のパレットエントリにコピーします。 指定パレットエントリに置き換える 対象選択パレットエントリの平均色にする- 
対象となるパレットエントリの平均色を求めて、その平均色に置き換えます。
 
後処理
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本処理のあとで行う作業を選択します。
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何もしない 本処理(統合や置き換え)のみを行います。空きパレットエントリを整理する イメージ側で使用していない「空きパレットエントリ」に対して、後処理を行います。空きパレットエントリを初期化する空きパレットエントリを指定色で初期化します。 空きパレットエントリを破棄して 
 パレットサイズを縮小イメージ側で使用していない「空きパレットエントリ」の分を詰めて、パレットサイズを縮小します。
